Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOBPQ9H2D6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIOBPQ9H2D6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms