Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COMMD5Q9GZQ3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD5Q9GZQ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms