Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR12Q9C0I1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR12Q9C0I1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR12Q9C0I1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR12Q9C0I1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR12Q9C0I1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR12Q9C0I1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR12Q9C0I1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR12Q9C0I1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR12Q9C0I1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms