Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms