Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms