Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms