Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB2BQ9BVA1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms