Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms