Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TM2D3Q9BRN9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms