Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MESP1Q9BRJ9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms