Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
FYCO1Q9BQS8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.82■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.81■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.81■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.8■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.78■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms