Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms