Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BPIFA3Q9BQP9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms