Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FERMT1Q9BQL6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms