Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID3AQ99856 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms