Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms