Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF6Q99612 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms