Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP1Q99575 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP1Q99575 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POP1Q99575 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POP1Q99575 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POP1Q99575 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POP1Q99575 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POP1Q99575 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP1Q99575 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POP1Q99575 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POP1Q99575 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POP1Q99575 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POP1Q99575 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POP1Q99575 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POP1Q99575 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POP1Q99575 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POP1Q99575 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POP1Q99575 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POP1Q99575 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POP1Q99575 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POP1Q99575 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP1Q99575 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP1Q99575 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP1Q99575 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP1Q99575 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP1Q99575 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP1Q99575 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP1Q99575 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP1Q99575 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP1Q99575 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP1Q99575 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP1Q99575 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms