Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms