Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCCC1Q96RQ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms