Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CICQ96RK0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms