Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms