Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CR12Q96Q35 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms