Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMTK3Q96Q04 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms