Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP3Q96P20 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms