Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms