Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD6Q96NK8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEUROD6Q96NK8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms