Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms