Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC7Q96M83 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms