Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms