Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms