Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC4Q96FT7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms