Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms