Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXorf40BQ96DE9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXorf40BQ96DE9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.4 ms