Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms