Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms