Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms