Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR2Q969E8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR2Q969E8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms