Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PRG4Q92954 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRG4Q92954 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms