Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDAQ92838 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDAQ92838 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDAQ92838 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDAQ92838 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDAQ92838 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDAQ92838 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDAQ92838 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDAQ92838 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDAQ92838 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDAQ92838 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDAQ92838 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDAQ92838 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDAQ92838 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDAQ92838 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EDAQ92838 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDAQ92838 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDAQ92838 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDAQ92838 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDAQ92838 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDAQ92838 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDAQ92838 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDAQ92838 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDAQ92838 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDAQ92838 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDAQ92838 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDAQ92838 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms