Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms