Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG1Q8WTW3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG1Q8WTW3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms