Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX54Q8TDD1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms