Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG50

RDM1, RAD52 motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1Q8NG50 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDM1Q8NG50 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDM1Q8NG50 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms