Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP32Q8NFA0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP32Q8NFA0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms