Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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