Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGBL3Q8NEM8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGBL3Q8NEM8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGBL3Q8NEM8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGBL3Q8NEM8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGBL3Q8NEM8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
AGBL3Q8NEM8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGBL3Q8NEM8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
AGBL3Q8NEM8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGBL3Q8NEM8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGBL3Q8NEM8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGBL3Q8NEM8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGBL3Q8NEM8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGBL3Q8NEM8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGBL3Q8NEM8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms