Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM3Q8NE01 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms