Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms