Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms